A CNM trabalhou incansavelmente para garantir que os Municípios não ficassem prejudicados na gestão dos recursos que foram bloqueados nas contas destinadas ao custeio dos serviços de saúde à população. A Confederação emitiu uma nota em 24 de dezembro, alertando sobre os riscos da decisão e essa nota foi integralmente usada pela advocacia da Câmara dos Deputados para fornecer esclarecimentos ao STF e reforçar o pedido de liberação dos recursos. As preocupações dos Municípios, expressas pela CNM, tiveram grande influência na decisão do ministro.
Com o início do novo mandato dos atuais prefeitos, a CNM reuniu diversas áreas, como Saúde, Contabilidade e Obras, Transferências e Parcerias, a fim de esclarecer alguns pontos importantes. As informações presentes no documento são embasadas na legislação vigente até o dia 2 de janeiro. A atuação da CNM foi fundamental para garantir que os Municípios não ficassem desamparados diante dessa situação delicada.